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PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!
更新時間:2018-08-22   點擊次數:1908次

PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!

 

儲存條件
該產品在常溫下運輸,收到產品后,請立即放-20 ℃冰箱低溫保存。該條件下,至少2年內有效。

 

產品用途
《PCR法支原體檢測試劑盒》可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:(1)體外細胞培養的上清;(2)血清;(3)各種體液,如唾液、尿液、鼻腔分泌物等;(4)別的液體樣品。本產品僅供研究使用。

 

產品簡介
哺乳動物細胞的培養,支原體(Mycoplasma)污染是個世界性的問題。支原體污染幾乎可以改變細胞的所有參數,導致實驗結果的不準確、甚至*錯誤。從2013年開始,《Nature》期刊已正式要求投稿的文章,如涉及細胞培養都要進行支原體檢測。相信會有越來越多的高水平期刊將做出同樣的支原體檢測要求。
培養法是相對可靠的支原體檢測技術,但是該方法非常耗時的,需要數周,不適合作為細胞培養液中支原體污染的快速檢測。此外,通過固體培養法無法檢測污染細胞的一種zui常見的支原體,即豬鼻支原體(M.Hyorhinis)。這是因為豬鼻支原體無法在支原體固體培養基上形成可見的菌落。而豬鼻支原體約占所有支原體污染的20-50%。

 

有的實驗室使用熒光染色法檢測支原體,但是該方法靈敏度太低,當檢測成陽性時,細胞經常已經嚴重污染。
目前,細胞培養液中支原體污染的檢測通常使用的是PCR法。但是PCR法也有明顯的缺點:(1)整個過程大約需要3個小時;(2)由于細胞培養數天后,培養液中經常含有嚴重抑制PCR擴增的代謝物,所以樣品的前處理一般是PCR法*的環節;(3)PCR法的靈敏度有限,通常需要將培養液離心濃縮或者抽提DNA后再檢測;(4)PCR產物的電泳,需要用到EB等潛在的致癌物質;(5)需要用到PCR儀、電泳槽、凝膠成像儀、離心機等儀器。

 

PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!



試劑盒組成

  • 支原體引物和內參(100次):206 μL
  • 陽性支原體DNA:50 μL
  • 注意1:本試劑盒提供的支原體引物和內參可供至少100次支原體檢測使用。
  • 注意2:以下試劑需要自己準備:(1)滅菌的去離子水;(2)普通的Taq DNA 聚合酶和相應的緩沖液;(3)2.5 mM的dNTP;(4)6× DNA上樣緩沖液。


檢測過程:

待測樣品的準備

為了準確判斷細胞是否有支原體的污染,待測的細胞培養液樣品來源于至少培養3天且匯合度在70-90%左右的細胞培養液上清(貼壁細胞)。懸浮培養的細胞也需要在換液傳代后,至少讓細胞生長3天再取培養液進行檢測。取150 μL上述待測樣品,在普通臺式離心機上1200 rpm (大約150-200 g)離心5 min,取離心后的上清100 μL用于支原體檢測,丟棄下層剩余的50 μL(含細胞沉淀)。收集并已經離心去除細胞的待測樣品如果不立即檢測,請放于-20℃或-80℃冰箱保存,不得放于室溫或4℃冰箱。樣品在-20℃至少可以保存一個月,在-80℃基本可以保存。

注意:本步驟的低速離心是為了去除哺乳動物細胞,以排除其不必要的干擾。所以離心力要嚴格控制在150-200 g,該離心力下,哺乳動物細胞將被沉淀下來而支原體不會。如果錯誤使用更高的離心力將可能導致支原體也被離心下來,從而導致假陰性。

 

PCR體系的配制

請按下表(表1)進行PCR體系(總體積25 μL)的配制:
 
 表1.PCR擴增體系的配制

 

Negative Control

Positive Control

Sample

去離子水

17.5 μL

15.5 μL

15.5 μL

10×Taq DNA 聚合酶緩沖液(含Mg2+)

2.5 μL

2.5 μL

2.5 μL

2.5 mM dNTP

2.5 μL

2.5 μL

2.5 μL

5 Units/μL Taq DNA 聚合酶

0.5 μL

0.5 μL

0.5 μL

支原體引物和內參

2 μL

2 μL

2 μL

陽性支原體DNA或待測樣品

-

2 μL

2 μL

 

結果判斷
    PCR擴增的結果有可能出現以下幾種情況(表2):
    表2. PCR擴增的可能結果

 

電泳結果

電泳結果

電泳結果

電泳結果

電泳結果

電泳結果

586 bp內參條帶

++

-

+

++

++

-

270 bp左右條帶

-

++++

+++

++

+

-

結果圖示(見圖1)

泳道1

泳道2

泳道3

泳道4

泳道5

泳道6

支原體污染判斷

陰性

極重度污染

重度污染

中度污染

輕度污染

PCR被抑制

 

    注:“-”代表沒有條帶;“+”代表有條帶;“+”號越多代表條帶越強。

圖1. 支原體PCR擴增結果。586 bp條帶為內參條帶,270 bp左右的條帶為支原體特異條帶(各支原體的條帶大小會略有不同,總體在260-280 bp)。隨著支原體DNA模板的增加,270 bp左右的條帶會逐漸增強而586 bp的內參條帶會逐漸減弱,甚至消失。泳道1:陰性對照或者沒有支原體污染的樣品;泳道2:極重度支原體污染樣品;泳道3:重度污染樣品;泳道4:中度污染樣品;泳道5:輕度污染樣品;泳道6:PCR的擴增被細胞的代謝產物抑制,導致擴增失敗。M:DNA marker.

 

注意事項

每次檢測都應該設有陰性對照,作用有:

(1)由于有效的PCR擴增,陰性對照也會有一條586 bp的內參條帶,這樣可以保證本試劑盒含有的支原體引物和內參以及自己準備的Taq DNA 聚合酶,dNTP等試劑沒有問題;

(2)只有當陰性對照的結果沒有出現270 bp左右的支原體特異條帶時,別的樣品的結果才是可信的。

 

如果586 bp條帶和270 bp左右的條帶都沒有出現(如圖1,泳道6),在排除PCR試劑的問題后(即陰性對照可以正常擴增),說明該樣品含有抑制PCR擴增的代謝產物。有關PCR的擴增會被細胞的代謝產物抑制的問題,Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的PCR法支原體檢測試劑盒說明書中也特別提到了這點,說明這是一個PCR法支原體檢測中經常遇到的問題,其強烈建議用試劑盒進行DNA提取后再進行鑒定。這也是PCR法支原體檢測的致命弱點。

 

為了克服該問題,以下問題必須注意:

(1)您購買的PCR法支原體檢測試劑盒,其擴增產物中必須含有內參(Internal Contol)條帶作為對照【本試劑盒的586 bp條帶就是內參條帶】。否則,如果沒有內參作為對照,即使樣品擴增后沒有支原體特異條帶,你也無法確定是因為樣品確實沒有支原體還是因為PCR被細胞的代謝產物抑制導致的假陰性。

(2)如果出現PCR的擴增被細胞的代謝產物抑制時,請使用血液基因組DNA抽提試劑盒,抽提支原體DNA后再進行PCR鑒定。

(3)同時使用本公司生物試劑的《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》進行檢測,經嚴格測試,該試劑盒的擴增不會被細胞的代謝產物抑制。

 

本試劑盒與Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的設計原理一樣,可以替代后者用于各類支原體的檢測。

 

根據支原體DNA的序列,本試劑盒可以識別所有100多種至今已發現的支原體,具有廣譜的識別能力。

 

如發現細胞被支原體污染,本公司提供細胞支原體清除和預防試劑。

 

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